More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3601 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
148 aa  309  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 
144 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  56.12 
 
 
148 aa  180  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 
147 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  61.15 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  57.55 
 
 
145 aa  167  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.25 
 
 
139 aa  164  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  50.36 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  53.9 
 
 
154 aa  156  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.29 
 
 
138 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.11 
 
 
139 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  47.29 
 
 
138 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  50 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.61 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.12 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.04 
 
 
137 aa  126  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.29 
 
 
137 aa  126  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  49.25 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  47.76 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.21 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  49.24 
 
 
140 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.19 
 
 
152 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.59 
 
 
143 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
150 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 
138 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.52 
 
 
140 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  47.29 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  48.15 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  46.21 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  48.06 
 
 
132 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.18 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  48.85 
 
 
145 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
143 aa  114  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.61 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  40.74 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  41.43 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  43.17 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  42.45 
 
 
134 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  42.45 
 
 
134 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  41.3 
 
 
148 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  44.7 
 
 
143 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 
150 aa  110  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  41.43 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  41.73 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  41.73 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  44.93 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  41.01 
 
 
134 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  41.73 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  41.73 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  41.73 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
144 aa  107  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  41.43 
 
 
134 aa  107  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 
143 aa  107  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.17 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.18 
 
 
287 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
142 aa  105  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
144 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  47.73 
 
 
142 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  42.22 
 
 
132 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  47.11 
 
 
127 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 
142 aa  103  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
151 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 
142 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 
142 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.14 
 
 
157 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 
140 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
275 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
146 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.48 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.55 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  36.31 
 
 
188 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  37.32 
 
 
254 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  40 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.41 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  42.66 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
257 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
255 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
258 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 
174 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
138 aa  90.9  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
138 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  42.2 
 
 
258 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
254 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
171 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
151 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.3 
 
 
299 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>