More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2401 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
169 aa  350  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.29 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.51 
 
 
140 aa  107  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
139 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
143 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
137 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.61 
 
 
138 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
138 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  36.57 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.01 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  38.4 
 
 
140 aa  90.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.81 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.81 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.84 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.15 
 
 
137 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  38.06 
 
 
148 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.4 
 
 
130 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.4 
 
 
130 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  40.8 
 
 
144 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
139 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.4 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  38.21 
 
 
140 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  37.3 
 
 
142 aa  84.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  39.53 
 
 
142 aa  84.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
147 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
132 aa  84.3  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
144 aa  84.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.71 
 
 
138 aa  84  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  33.6 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.24 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  37.12 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  33.33 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.37 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  34.93 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.77 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 
144 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  37.3 
 
 
144 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
255 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  36.92 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  37.4 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  32.61 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.6 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.03 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  44.32 
 
 
588 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.72 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  34.13 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  33.33 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  34.13 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  34.13 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
258 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  33.33 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  36.36 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  34.13 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  34.92 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  34.92 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  29.2 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  31.71 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  32.61 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.02 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  29.71 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  33.79 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  34.62 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  34.62 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  35.54 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.12 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  27.48 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  30.56 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  36.52 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>