232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0641 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  340  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.72 
 
 		 158 aa  213  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  68.31 
 
 		 158 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  66.24 
 
 		 159 aa  210  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  64.44 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  57.93 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  60.29 
 
 		 157 aa  174  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  59.56 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  55.24 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  52.74 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  55.24 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  50.68 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  54.55 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  53.19 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.11 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.31 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.62 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  55.4 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  51.43 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.71 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.71 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  51.43 
 
 		 142 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  46 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  44.83 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 151 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  43.75 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  41.26 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.61 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  35.29 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  33.58 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  29.71 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  30.37 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.07 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.2 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  32.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.09 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.46 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.19 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.1 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  30.14 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.47 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  29.37 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  32.37 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  28.99 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.03 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  30.33 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.48 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  27.78 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  30.16 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  28.47 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  28.47 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  27.15 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  29.77 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  27.74 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  29.58 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  29.01 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  29.71 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  27.91 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  29.01 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.36 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  29.55 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  28.47 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  28.47 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  29.6 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  27.01 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  29.41 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>