243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0188 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  60.87 
 
 		 157 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  60 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  60.27 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  60.87 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  64.44 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  57.35 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.09 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  51.11 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  51.05 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  51.05 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  47.62 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  51.41 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.83 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 152 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 		 149 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.66 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.08 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  52.11 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.98 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.98 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  51.63 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 		 142 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  41.55 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 144 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.29 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.3 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.09 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.37 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  29.77 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  32.14 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.43 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  31.06 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.33 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  29.33 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  31.58 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  27.54 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  26.92 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  27.91 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  28.28 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  29.23 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  29.77 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 255 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  30.4 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  27.82 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.11 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.94 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  26.43 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.03 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  31.01 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  30.91 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.87 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.3 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  30.08 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  28.79 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 257 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  26.62 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.27 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  27.61 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  30.66 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  24.48 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.01 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  28.67 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  27.66 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  30.16 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  29.13 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  28.24 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  28.47 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  27.69 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  30.7 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  30.7 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.83 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>