More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3514 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 142 aa  293  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  87.32 
 
 		 157 aa  270  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  87.23 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  87.23 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  80.14 
 
 		 155 aa  237  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  79.43 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  63.31 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  62.86 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  61.15 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  60.43 
 
 		 155 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.71 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  58.27 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  60.56 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  56.83 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  55.4 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  55.4 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  56.12 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  56.52 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.07 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  52.17 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  51.43 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  52.17 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  45.32 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  45.71 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  43.26 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  43.26 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 299 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.71 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.62 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.57 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  32.65 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.61 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  27.78 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.53 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.15 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  33.57 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  29.01 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.21 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  30.6 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.07 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.78 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  30.94 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  30.22 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  27.59 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.73 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  28.36 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  31.69 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  27.82 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  25.53 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 258 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  35.34 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  32.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.83 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  32.82 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  30.23 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  29.77 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.51 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.1 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.15 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.58 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  26.67 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  29.5 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  28.24 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>