More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4277 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 149 aa  311  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  85.81 
 
 		 155 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  83.67 
 
 		 152 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  83.67 
 
 		 155 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  76.6 
 
 		 156 aa  229  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.73 
 
 		 170 aa  224  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  68.75 
 
 		 155 aa  216  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.16 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  55 
 
 		 153 aa  169  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.07 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  58.99 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.27 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.27 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  56.83 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  57.04 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.17 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  53.79 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  55.4 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  57.97 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  53.19 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  51.08 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  49.01 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  51.45 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  48.59 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  48.25 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  51.45 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  45.14 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 		 160 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  35.97 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  34.06 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.43 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.11 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.21 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.06 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.11 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  31.88 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  34.06 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.08 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  34.75 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  41.11 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  33.82 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.39 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.87 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.09 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.58 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.5 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.84 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  34.09 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  27.82 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  34.35 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.45 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  42.7 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  29.33 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  30.15 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  34.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  33.06 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  33.09 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  31.94 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  30.22 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.89 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  33.88 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 255 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  29.5 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.5 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  37.5 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.77 
 
 		 588 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.96 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.76 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.76 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  30.28 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>