More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4415 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 155 aa  323  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  83.67 
 
 		 149 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  82.67 
 
 		 155 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  81.88 
 
 		 152 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  76.87 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.85 
 
 		 170 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  69.54 
 
 		 155 aa  224  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  57.82 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.82 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.49 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  59.31 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.62 
 
 		 157 aa  170  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.62 
 
 		 157 aa  170  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  58.27 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  54 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.33 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  55.41 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  59.86 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  54.48 
 
 		 150 aa  160  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  54.55 
 
 		 167 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  51.41 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  47.62 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  51.41 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  49.65 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 161 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  50.69 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  50.69 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  45.77 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  34.09 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.82 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.65 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  32.39 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.88 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.76 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  35.29 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  36.17 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.29 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.78 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.06 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  31.88 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.11 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  34.59 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.08 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  28.79 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  34.07 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.61 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  33.58 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.59 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.46 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.88 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  34.06 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.33 
 
 		 287 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  30.22 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.34 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  34.62 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  34.06 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  30.61 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  35.43 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  32.33 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.28 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.35 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.28 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  32.35 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.09 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>