More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4719 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  64.18 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  66.41 
 
 
137 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.54 
 
 
145 aa  158  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  56.06 
 
 
142 aa  150  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  60.15 
 
 
138 aa  149  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  57.04 
 
 
151 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  57.81 
 
 
138 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  57.25 
 
 
148 aa  146  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  57.03 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.89 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.38 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2256  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.65 
 
 
128 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.829785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.2 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.78 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  44.62 
 
 
135 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  45.19 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.03 
 
 
215 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.19 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  44.78 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.79 
 
 
135 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.97 
 
 
135 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 
223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 
150 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  43.38 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  41.54 
 
 
140 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
225 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
222 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.04 
 
 
453 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 
136 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.3 
 
 
150 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.65 
 
 
141 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
225 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
148 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.65 
 
 
141 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  43.7 
 
 
136 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
157 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  40.74 
 
 
498 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 
347 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  38.06 
 
 
294 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.77 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.63 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  45.8 
 
 
337 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.92 
 
 
408 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.94 
 
 
336 aa  87.8  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  38.28 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.23 
 
 
227 aa  83.6  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 
227 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.41 
 
 
219 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  36.51 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  39.37 
 
 
337 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  38.69 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.68 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
349 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  35.04 
 
 
255 aa  77  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.44 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  34.59 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.38 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.04 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  40.32 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  36.8 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  37.21 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.81 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.31 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.3 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.54 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.88 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.34 
 
 
287 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.56 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.11 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
143 aa  66.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  37.3 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  39.2 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.81 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  35.2 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>