243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2681 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  91.91 
 
 
136 aa  251  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  64.75 
 
 
142 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  57.94 
 
 
138 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.38 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  54.07 
 
 
137 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.63 
 
 
145 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
147 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  49.63 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 
151 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  48.46 
 
 
142 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2256  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.15 
 
 
128 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.829785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.11 
 
 
215 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.91 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  40.91 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  40.62 
 
 
498 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.09 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
217 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
217 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
223 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
217 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  37.5 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  35.16 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.26 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.1 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.35 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.88 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  37.88 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.17 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.77 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.81 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  35.94 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.09 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.61 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.07 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.88 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  35.61 
 
 
337 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 
337 aa  67  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.59 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  35.16 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
347 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.4 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.83 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.21 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.51 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  31.11 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.63 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.48 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  30.56 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  29.23 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.43 
 
 
227 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.66 
 
 
227 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  32.84 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  30.15 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  32.37 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  36.28 
 
 
336 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  36.44 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.56 
 
 
299 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  36.03 
 
 
299 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.78 
 
 
408 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.31 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  32.37 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
188 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.08 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.85 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  27.61 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  27.82 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.51 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  40 
 
 
267 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.04 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  34.58 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.78 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.5 
 
 
130 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.16 
 
 
219 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  30.47 
 
 
255 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>