More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4720 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
139 aa  283  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  85.38 
 
 
136 aa  234  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  78.79 
 
 
150 aa  219  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  79.39 
 
 
139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.64 
 
 
138 aa  216  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  74.63 
 
 
453 aa  215  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.88 
 
 
150 aa  212  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.81 
 
 
135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  74.05 
 
 
136 aa  207  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  74.81 
 
 
135 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.24 
 
 
143 aa  202  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.66 
 
 
137 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  71.43 
 
 
147 aa  199  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.99 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  72.52 
 
 
148 aa  198  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.7 
 
 
139 aa  197  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  67.15 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70 
 
 
141 aa  191  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.23 
 
 
136 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70 
 
 
141 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  64.18 
 
 
215 aa  188  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  67.15 
 
 
136 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  67.65 
 
 
223 aa  186  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  67.69 
 
 
217 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  67.69 
 
 
217 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  67.69 
 
 
217 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  65.15 
 
 
136 aa  183  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  64.49 
 
 
498 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  65.38 
 
 
225 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  66.15 
 
 
225 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  63.85 
 
 
222 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  64.39 
 
 
294 aa  179  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  69.49 
 
 
138 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  64.18 
 
 
157 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.46 
 
 
408 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.54 
 
 
227 aa  161  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.46 
 
 
227 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.82 
 
 
219 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  54.76 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
337 aa  148  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  55.12 
 
 
347 aa  140  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  52.24 
 
 
174 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  52.76 
 
 
337 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  48.48 
 
 
135 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.41 
 
 
130 aa  130  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.91 
 
 
229 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 
349 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  47.93 
 
 
336 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.31 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.7 
 
 
151 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  43.44 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  47.76 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  42.22 
 
 
151 aa  106  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.65 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  40.32 
 
 
134 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  41.41 
 
 
132 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.09 
 
 
140 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
133 aa  105  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  40.62 
 
 
132 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  42.34 
 
 
142 aa  103  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
145 aa  103  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  41.27 
 
 
138 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  43.8 
 
 
164 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  45.9 
 
 
132 aa  100  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  38.93 
 
 
131 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  40.74 
 
 
138 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
137 aa  100  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.24 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 
142 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.75 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 
135 aa  97.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.86 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  39.53 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  39.53 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  44.88 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  36.29 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  39.69 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
137 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  40.31 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
143 aa  94.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  40.31 
 
 
130 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.91 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  38.97 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  37.21 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
287 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
137 aa  93.6  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>