More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5379 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  87.22 
 
 
136 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  82.71 
 
 
136 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  52.43 
 
 
223 aa  224  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  50.72 
 
 
217 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  50.72 
 
 
217 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  50.72 
 
 
217 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  50.24 
 
 
222 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  50.25 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.86 
 
 
136 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
225 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  67.65 
 
 
136 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.94 
 
 
137 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.36 
 
 
219 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.27 
 
 
227 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  67.16 
 
 
140 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.76 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70 
 
 
139 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.17 
 
 
139 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  67.94 
 
 
135 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.18 
 
 
135 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  73.73 
 
 
138 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  67.97 
 
 
147 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.23 
 
 
150 aa  188  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  66.41 
 
 
453 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.89 
 
 
138 aa  188  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.18 
 
 
139 aa  188  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  65.65 
 
 
135 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  68.7 
 
 
136 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.92 
 
 
141 aa  185  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.19 
 
 
150 aa  184  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.93 
 
 
141 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  64.44 
 
 
148 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.41 
 
 
143 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  64.06 
 
 
498 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 
347 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  47.03 
 
 
337 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  62.5 
 
 
157 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.45 
 
 
229 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  47.32 
 
 
337 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 
349 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  59.54 
 
 
174 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  57.81 
 
 
294 aa  158  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  45.41 
 
 
336 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  58.73 
 
 
144 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.97 
 
 
130 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 
408 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  47.45 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.82 
 
 
147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  46.92 
 
 
148 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 
132 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
137 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
135 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.55 
 
 
145 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 
140 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  43.38 
 
 
137 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.91 
 
 
151 aa  106  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
138 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  41.4 
 
 
151 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  43.88 
 
 
142 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26410  protein-tyrosine-phosphatase  28.93 
 
 
239 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  32.98 
 
 
255 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  41.3 
 
 
146 aa  104  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  43.94 
 
 
138 aa  104  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  41.8 
 
 
125 aa  101  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
137 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
134 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  36.64 
 
 
133 aa  98.6  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.73 
 
 
154 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
139 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
135 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  42.97 
 
 
142 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.41 
 
 
140 aa  95.9  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  41.35 
 
 
138 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
143 aa  95.5  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  37.9 
 
 
135 aa  95.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 
142 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  43.2 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.58 
 
 
144 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
131 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  35.2 
 
 
135 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.11 
 
 
136 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.11 
 
 
136 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  37.88 
 
 
133 aa  91.7  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  39.53 
 
 
126 aa  91.7  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
141 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  43.55 
 
 
132 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
151 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
141 aa  89  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
135 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
152 aa  89  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  37.98 
 
 
130 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  37.21 
 
 
130 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
142 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
150 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
140 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
137 aa  85.9  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.42 
 
 
143 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 
148 aa  85.9  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  36.43 
 
 
131 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>