More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4721 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  63.16 
 
 
227 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.9 
 
 
227 aa  250  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  52.36 
 
 
215 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
223 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  51.02 
 
 
222 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  48.11 
 
 
217 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  48.11 
 
 
217 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  48.11 
 
 
217 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.52 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  54.67 
 
 
347 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  48.21 
 
 
225 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  49.21 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 
349 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50.96 
 
 
337 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  52.61 
 
 
337 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  53.3 
 
 
336 aa  181  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.67 
 
 
136 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.69 
 
 
136 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  65.35 
 
 
136 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.85 
 
 
139 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  58.59 
 
 
140 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.69 
 
 
137 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.82 
 
 
139 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.8 
 
 
136 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.8 
 
 
138 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.02 
 
 
139 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.59 
 
 
135 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  58.91 
 
 
136 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  56.82 
 
 
135 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  56.3 
 
 
453 aa  157  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  63.25 
 
 
138 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.64 
 
 
135 aa  154  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  57.6 
 
 
147 aa  154  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60 
 
 
150 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60 
 
 
143 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  54.2 
 
 
498 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.8 
 
 
150 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.36 
 
 
141 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.56 
 
 
141 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  57.81 
 
 
148 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  56.35 
 
 
174 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  56 
 
 
294 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  53.6 
 
 
157 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  52.8 
 
 
144 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  38.31 
 
 
255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26410  protein-tyrosine-phosphatase  38.42 
 
 
239 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.21 
 
 
130 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.03 
 
 
408 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 
147 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 
132 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  40.48 
 
 
137 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 
151 aa  106  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 
148 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  42.34 
 
 
151 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
135 aa  98.2  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  40.98 
 
 
125 aa  97.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  41.67 
 
 
142 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.41 
 
 
140 aa  95.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
137 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.69 
 
 
143 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 
134 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  39.69 
 
 
138 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  40.31 
 
 
146 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 
135 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  33.85 
 
 
135 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 
126 aa  92  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1732  arsenate reductase  37.8 
 
 
140 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.044466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.16 
 
 
140 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
135 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.17 
 
 
144 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
138 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.06 
 
 
145 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
139 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
137 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  34.15 
 
 
133 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  32.8 
 
 
135 aa  85.9  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3446  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.09 
 
 
150 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.45 
 
 
127 aa  84.7  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  34.65 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  34.65 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
141 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
133 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
150 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.79 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 
142 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42 
 
 
142 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  36.62 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  40.87 
 
 
132 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  37.6 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>