More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0143 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  100 
 
 
146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  84.17 
 
 
138 aa  234  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  83.46 
 
 
137 aa  233  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  42.22 
 
 
157 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 
139 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.3 
 
 
215 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  42.54 
 
 
136 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 
138 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.64 
 
 
130 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  39.55 
 
 
135 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.43 
 
 
453 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.18 
 
 
136 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 
148 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
217 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
217 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
217 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 
150 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
150 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 
222 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  42.11 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
223 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.3 
 
 
135 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
225 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  40.15 
 
 
498 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
225 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  35.07 
 
 
294 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  39.85 
 
 
337 aa  94.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.97 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.81 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.41 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.7 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.55 
 
 
135 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.98 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.96 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.31 
 
 
227 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.51 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.09 
 
 
227 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
347 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  36.8 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.31 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
337 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1304  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.06 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  43.69 
 
 
336 aa  78.2  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0704  arsenate reductase  35.16 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  36.64 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  35.88 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
408 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  33.33 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 
254 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.15 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  35.88 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  28.99 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  31.25 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.54 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  29.46 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
257 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  31.06 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  31.82 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  31.06 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
284 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  36.64 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  30.94 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.54 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  31.11 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  29.66 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  28.79 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1732  arsenate reductase  30.53 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.044466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.77 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.59 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  28.79 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>