More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0366 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
138 aa  283  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  81.48 
 
 
150 aa  233  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  81.48 
 
 
150 aa  233  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  81.2 
 
 
147 aa  224  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  80.15 
 
 
135 aa  221  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  79.85 
 
 
143 aa  218  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  77.1 
 
 
136 aa  216  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.64 
 
 
139 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  78.63 
 
 
135 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.69 
 
 
136 aa  209  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  70.99 
 
 
453 aa  208  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.66 
 
 
139 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  72.52 
 
 
148 aa  204  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.09 
 
 
137 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.99 
 
 
135 aa  201  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  71.88 
 
 
140 aa  200  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.31 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.31 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.19 
 
 
139 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  65.19 
 
 
294 aa  189  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  65.38 
 
 
222 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  64.89 
 
 
215 aa  188  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  67.97 
 
 
498 aa  185  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  65.38 
 
 
223 aa  185  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  63.16 
 
 
136 aa  183  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  63.36 
 
 
157 aa  183  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.65 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  62.96 
 
 
225 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  64.12 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.89 
 
 
136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  62.31 
 
 
217 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  62.31 
 
 
217 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  62.31 
 
 
217 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  62.31 
 
 
225 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.16 
 
 
408 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.85 
 
 
227 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.58 
 
 
227 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  57.03 
 
 
337 aa  150  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.8 
 
 
219 aa  147  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  58.27 
 
 
347 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
144 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  51.15 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  54.14 
 
 
174 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  51.54 
 
 
337 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  54.62 
 
 
336 aa  132  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.41 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
135 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  56.69 
 
 
349 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.17 
 
 
229 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
147 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.21 
 
 
151 aa  117  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.54 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  43.2 
 
 
133 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.2 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  45.38 
 
 
131 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 
139 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.44 
 
 
143 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
138 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 
143 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  41.18 
 
 
138 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  41.73 
 
 
132 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
140 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  42.52 
 
 
132 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 
145 aa  103  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  40.88 
 
 
146 aa  102  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
134 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
137 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  41.86 
 
 
130 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
133 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  43.88 
 
 
164 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
151 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  41.09 
 
 
130 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  39.84 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  39.34 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.26 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  40.15 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  39.84 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  40.31 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 
135 aa  94.4  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  36.96 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  40.31 
 
 
137 aa  94  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  39.26 
 
 
151 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 
142 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  39.68 
 
 
137 aa  94  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  38.62 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.46 
 
 
287 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
135 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  37.5 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.13 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.8 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0704  arsenate reductase  41.98 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>