More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0792 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  91.63 
 
 		 227 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  63.16 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  51.27 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.83 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.93 
 
 		 136 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.42 
 
 		 136 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  50.53 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  50.53 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  50.53 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  66.93 
 
 		 136 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  54.36 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  45.13 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  45.64 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  51.63 
 
 		 347 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.36 
 
 		 349 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  52.11 
 
 		 336 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.73 
 
 		 139 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  62.2 
 
 		 147 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.69 
 
 		 137 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  53.14 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  60.63 
 
 		 136 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.31 
 
 		 139 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.77 
 
 		 135 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.46 
 
 		 139 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.42 
 
 		 136 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  60.47 
 
 		 135 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.58 
 
 		 138 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.02 
 
 		 141 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  58.27 
 
 		 148 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  55.47 
 
 		 140 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  57.69 
 
 		 453 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.06 
 
 		 141 aa  161  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  54.23 
 
 		 498 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.2 
 
 		 150 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.58 
 
 		 143 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.33 
 
 		 138 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.58 
 
 		 150 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  60.8 
 
 		 144 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.54 
 
 		 135 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  53.08 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  53.54 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  50.39 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  43.88 
 
 		 255 aa  138  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.17 
 
 		 130 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 		 148 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.8 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 		 137 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26410  protein-tyrosine-phosphatase  36.7 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  41.54 
 
 		 135 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.79 
 
 		 408 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 		 132 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.18 
 
 		 151 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.44 
 
 		 145 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 		 137 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  39.42 
 
 		 142 aa  99.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 		 133 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  40.31 
 
 		 146 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  39.31 
 
 		 151 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.69 
 
 		 143 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  38.76 
 
 		 138 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.4 
 
 		 140 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 		 140 aa  95.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 		 147 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 137 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 133 aa  93.2  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  37.5 
 
 		 138 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.64 
 
 		 140 aa  92.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  36.89 
 
 		 125 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  35.88 
 
 		 130 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  34.09 
 
 		 131 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  38.89 
 
 		 138 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  35.11 
 
 		 130 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1732  arsenate reductase  37.12 
 
 		 140 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.044466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 134 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  35.07 
 
 		 132 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  35.07 
 
 		 132 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.94 
 
 		 141 aa  86.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.84 
 
 		 142 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 131 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 		 139 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 		 151 aa  85.1  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 141 aa  85.1  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 145 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  31.2 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  36.57 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  32.81 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  38.4 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.56 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.11 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.43 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  31.2 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 		 142 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  33.6 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>