121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26410  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.121737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  33.85 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  31.12 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.42 
 
 
219 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  28.93 
 
 
215 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.7 
 
 
227 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.13 
 
 
227 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.51 
 
 
229 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.56 
 
 
136 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 
337 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.3 
 
 
136 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.88 
 
 
135 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  34.12 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 
140 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  36.92 
 
 
294 aa  82  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.82 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  32.41 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  34.35 
 
 
135 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.85 
 
 
139 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
138 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
136 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.11 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.59 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.09 
 
 
139 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.07 
 
 
150 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 
144 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.09 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.38 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  30.96 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.35 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.59 
 
 
136 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.4 
 
 
130 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.33 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.48 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.33 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.08 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.53 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  33.08 
 
 
498 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  31.9 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  31.78 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.11 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 
148 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  31.5 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  34.62 
 
 
130 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  33.01 
 
 
137 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
137 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 
135 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.72 
 
 
147 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  33.08 
 
 
130 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.21 
 
 
145 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  31.54 
 
 
131 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.06 
 
 
140 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  27.42 
 
 
133 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  28.86 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  29.92 
 
 
133 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  25.19 
 
 
133 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
127 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3446  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.99 
 
 
150 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  34.18 
 
 
134 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  34.18 
 
 
134 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.95 
 
 
140 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  28.03 
 
 
146 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.78 
 
 
141 aa  52  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  31.65 
 
 
131 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  26.09 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  31.25 
 
 
134 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  28.47 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  28.03 
 
 
141 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 
143 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  28.33 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  24.81 
 
 
150 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  26.95 
 
 
144 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.52 
 
 
154 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.23 
 
 
588 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  26.09 
 
 
145 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  28.24 
 
 
138 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.5 
 
 
144 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  26.92 
 
 
137 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.56 
 
 
321 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  29.11 
 
 
148 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.92 
 
 
140 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  28.35 
 
 
126 aa  48.5  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  31.65 
 
 
134 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  30.38 
 
 
134 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  30.38 
 
 
134 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  30.38 
 
 
134 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  30.38 
 
 
134 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>