More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0227 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  83.46 
 
 
146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  79.55 
 
 
138 aa  216  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.62 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  43.38 
 
 
215 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
139 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
150 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
157 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
136 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.79 
 
 
136 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.11 
 
 
138 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  38.35 
 
 
135 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
140 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 
223 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 
141 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
148 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.03 
 
 
453 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.52 
 
 
150 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 
136 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
135 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.97 
 
 
143 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
141 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.6 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  41.22 
 
 
498 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 
217 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 
217 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 
217 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  42.31 
 
 
147 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.04 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 
225 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
137 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 
222 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 
225 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.06 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  36.92 
 
 
294 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.22 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.37 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
337 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
227 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
227 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  40.46 
 
 
347 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
219 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.61 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
337 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 
133 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  37.69 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  36.92 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.07 
 
 
408 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.07 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
254 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1304  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.12 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.05 
 
 
229 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  36.92 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
255 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.09 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  30.94 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
257 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  33.6 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  35.4 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  31.25 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.62 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  33.57 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.4 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0704  arsenate reductase  32.84 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  36.52 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.86 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.52 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  35.85 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  26.56 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>