More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0834 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  100 
 
 
132 aa  273  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  98.48 
 
 
132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  71.76 
 
 
136 aa  197  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1304  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.92 
 
 
133 aa  185  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  63.36 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1068  protein tyrosine phosphatase  68.03 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  63.64 
 
 
133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  58.78 
 
 
135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  62.2 
 
 
137 aa  158  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0704  arsenate reductase  59.35 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  54.33 
 
 
137 aa  140  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  43.55 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  46.03 
 
 
140 aa  116  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.83 
 
 
135 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  45.24 
 
 
134 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1732  arsenate reductase  41.18 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.044466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
135 aa  107  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  41.46 
 
 
294 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  43.31 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 
135 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
135 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
135 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.94 
 
 
136 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.73 
 
 
138 aa  104  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
139 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
135 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
141 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.37 
 
 
453 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.16 
 
 
141 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
126 aa  100  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  39.37 
 
 
136 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.23 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.94 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  40.8 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.06 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1094  arsenate reductase  48.54 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  39.37 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.02 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.2 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  42.75 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  40 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  38.21 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.61 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.8 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.28 
 
 
136 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
223 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  38.1 
 
 
498 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  41.22 
 
 
130 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 
217 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 
217 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  37.6 
 
 
217 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 
131 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  41.22 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  37.69 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
225 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.43 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.1 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
222 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  36.8 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.22 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.65 
 
 
408 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  38.76 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  38.1 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  36 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  34.13 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  36.76 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.01 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.94 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.29 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  39.55 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.56 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.46 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  37.96 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  36.64 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  36.29 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  36.29 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.13 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.69 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  37.1 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.07 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  36.84 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>