More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1447 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 408 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.37 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  61.35 
 
 		 247 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  60.66 
 
 		 245 aa  255  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  55.97 
 
 		 260 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  58.33 
 
 		 261 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  54.5 
 
 		 233 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  52.27 
 
 		 234 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  51.82 
 
 		 234 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  50.65 
 
 		 235 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  50.22 
 
 		 235 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  50.9 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  50.45 
 
 		 232 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  50 
 
 		 248 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  51.94 
 
 		 223 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  47.79 
 
 		 232 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  50 
 
 		 233 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  50.72 
 
 		 219 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  50 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  58.78 
 
 		 136 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  50.24 
 
 		 233 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  48.62 
 
 		 232 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.16 
 
 		 138 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  52.71 
 
 		 235 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.46 
 
 		 139 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.15 
 
 		 139 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  59.54 
 
 		 135 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  50 
 
 		 232 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.03 
 
 		 150 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.03 
 
 		 150 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  57.14 
 
 		 498 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  57.81 
 
 		 148 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.73 
 
 		 137 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.72 
 
 		 141 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.46 
 
 		 141 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.49 
 
 		 135 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  51.52 
 
 		 140 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.59 
 
 		 136 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.31 
 
 		 135 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  53.91 
 
 		 147 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.91 
 
 		 139 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  54.26 
 
 		 223 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  51.56 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.54 
 
 		 143 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  50.37 
 
 		 222 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  51.94 
 
 		 136 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  45.5 
 
 		 222 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  54.55 
 
 		 138 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  50 
 
 		 215 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  50.78 
 
 		 157 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.49 
 
 		 136 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  50 
 
 		 136 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  44.89 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  50.78 
 
 		 217 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  50.78 
 
 		 217 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  50.78 
 
 		 217 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 225 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 225 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  40.18 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 147 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  40.18 
 
 		 246 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 135 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.29 
 
 		 227 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.48 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.79 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.03 
 
 		 219 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 		 137 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.3 
 
 		 145 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 		 133 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 		 148 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 		 143 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  34.85 
 
 		 231 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 		 174 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 		 131 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.51 
 
 		 130 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.74 
 
 		 229 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.92 
 
 		 140 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  39.37 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 		 138 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  34.9 
 
 		 151 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  36.17 
 
 		 142 aa  86.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 		 151 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 		 137 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  38.28 
 
 		 130 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.54 
 
 		 140 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  34.88 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  37.5 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  35.88 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 142 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.43 
 
 		 147 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  34.65 
 
 		 132 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  34.65 
 
 		 132 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>