153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3274 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  100 
 
 		 246 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  96.34 
 
 		 246 aa  407  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  60.09 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  58.26 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  46.81 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  48.37 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  45.5 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  46.26 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  46.95 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  44.29 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  42.92 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  48.6 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  48.02 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  46.79 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  47.2 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  44.53 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  47.2 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  45.66 
 
 		 232 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  47.06 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  48.17 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  45.32 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  41.8 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.5 
 
 		 453 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  43.23 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  42.79 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.87 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  41.05 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  35.96 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  34.31 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  32.54 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  41.28 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  42.39 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  29.41 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  29.83 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  29.44 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  37.38 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  37.38 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  40.21 
 
 		 357 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  39.25 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  40.19 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  35.79 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  37.38 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  29.44 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  29.41 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  29.22 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  31.54 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  31.54 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  32.12 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  37.38 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  29.82 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  27.08 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  26.78 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  40.19 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  35.61 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  36.45 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  35.85 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  37.27 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  29.8 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  34.91 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  32.9 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  36.45 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  35.42 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  32.95 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  32.95 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  33.64 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  33.33 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  34.04 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  27.71 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  32.77 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  32.43 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  37.86 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  33.64 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3485  major intrinsic protein  37.86 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  35.51 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  33.33 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  43.27 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  37.01 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  28.65 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  28.65 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  33.93 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  31.53 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  33.93 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  33.93 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  28.65 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  28.65 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  36.36 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  26.74 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  33.64 
 
 		 275 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  31.25 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  29.24 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  29.24 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  32.43 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  32.43 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  38.38 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  32.43 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>