More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0786 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  100 
 
 
239 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  91.63 
 
 
239 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  92.47 
 
 
239 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  84.52 
 
 
239 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  69.39 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  68.16 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  65.16 
 
 
247 aa  285  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  56.85 
 
 
248 aa  261  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  64.9 
 
 
247 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  51.85 
 
 
249 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  41.88 
 
 
278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  37.82 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  37.82 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  37.65 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  36.73 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  38.87 
 
 
232 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  36.33 
 
 
231 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  36.33 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  36.33 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  35.92 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  36.93 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  35.29 
 
 
234 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  35.92 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  37.3 
 
 
232 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  39.92 
 
 
226 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  35.89 
 
 
246 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  35.22 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  35.95 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  39.64 
 
 
246 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  38.24 
 
 
230 aa  121  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  36.69 
 
 
246 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  38.02 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  37.4 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  36.48 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  36.07 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  37.19 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  35.1 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  37.08 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  37.6 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  37.34 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  38.63 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  35.98 
 
 
279 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  35.83 
 
 
230 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  35.61 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  36.07 
 
 
245 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  37.02 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  34.47 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  34 
 
 
241 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.25 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  36.63 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  36.36 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  35.58 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  34.69 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  35.27 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  34.87 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  34.58 
 
 
230 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  35.27 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  34.87 
 
 
281 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  34.1 
 
 
281 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  34.46 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  33.58 
 
 
281 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  34.46 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  34.46 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  33.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  33.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  33.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  34.41 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  35.92 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  33.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  35.6 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  36.67 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  34.78 
 
 
263 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  35.56 
 
 
229 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  34.84 
 
 
237 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  35.6 
 
 
232 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  34.02 
 
 
229 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  35.6 
 
 
230 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  35.51 
 
 
244 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  36.33 
 
 
248 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  34.24 
 
 
284 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  36.82 
 
 
237 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  34.24 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  34.8 
 
 
279 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  37.14 
 
 
246 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  34.16 
 
 
236 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  33.61 
 
 
229 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  34.84 
 
 
231 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  35.48 
 
 
238 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>