More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1139 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  100 
 
 		 245 aa  470  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  77.14 
 
 		 250 aa  351  5e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  75 
 
 		 247 aa  345  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  71.02 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  67.35 
 
 		 239 aa  306  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  71.43 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  68.98 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  67.76 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  58.94 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  56.73 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  40.85 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  35.66 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  35.66 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  34.52 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  36.8 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  33.6 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  37.2 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  33.2 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  33.2 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  35.48 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  35.18 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  38.65 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  36.22 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  35.29 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  33.07 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  32.39 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  37.35 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  34.92 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  34.92 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  34.27 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  31.98 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  31.75 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  31.98 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  36.11 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  36.11 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  35.6 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  32.81 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  33.83 
 
 		 281 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  35.86 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  34.44 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  34.27 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  36.13 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  32.24 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  32.71 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  34.39 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  31.95 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  32.33 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  34.15 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  35.06 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  34.65 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  31.95 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  31.95 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  32.81 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  33.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  35.08 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  35.6 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  36.19 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  33.06 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  34.38 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  34.4 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  33.46 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  33.6 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  33.33 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  33.6 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  34.98 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  34.29 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  32.94 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  33.87 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  32.71 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  31.95 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  37.21 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  37.21 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  33.08 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  32.71 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  33.08 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  31.3 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  37.74 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  42.11 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  31.42 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  34.13 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  34.3 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.33 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  31.23 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  32.94 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  32.94 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  31.05 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  32.94 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>