More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0011 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  100 
 
 
232 aa  448  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  56.22 
 
 
234 aa  247  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  52.79 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  53.42 
 
 
246 aa  234  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  55.31 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  54.15 
 
 
237 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  50.22 
 
 
231 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  51.29 
 
 
246 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  53.3 
 
 
240 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  53.85 
 
 
234 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  53.85 
 
 
234 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  53.85 
 
 
234 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  53.85 
 
 
234 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  53.85 
 
 
234 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  53.85 
 
 
234 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  50 
 
 
249 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  53.39 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  52.94 
 
 
254 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  51.54 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  53.1 
 
 
232 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  53.1 
 
 
232 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  51.56 
 
 
232 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  52.86 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  50.43 
 
 
232 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  53.1 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  50.62 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  52.68 
 
 
230 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  52.7 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  53.57 
 
 
234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  52.7 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  52.7 
 
 
247 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  51.1 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  52.7 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  52.25 
 
 
230 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  54.34 
 
 
232 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  53.85 
 
 
234 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  52.25 
 
 
248 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  51.34 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  51.34 
 
 
231 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  50 
 
 
232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  54.76 
 
 
236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  50.66 
 
 
231 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  50.45 
 
 
231 aa  214  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  51.56 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  51.32 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  51.3 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  51.27 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  50.66 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  51.34 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  51.35 
 
 
235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  52.25 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  50 
 
 
232 aa  211  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  54.15 
 
 
238 aa  211  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  54.37 
 
 
246 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  51.54 
 
 
244 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  54.37 
 
 
246 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  53.51 
 
 
243 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  50.89 
 
 
229 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  50.44 
 
 
229 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  50 
 
 
231 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  48.44 
 
 
234 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  49.56 
 
 
229 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  50 
 
 
231 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  50.45 
 
 
228 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  50.22 
 
 
247 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  50 
 
 
231 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  48.67 
 
 
246 aa  207  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  48.86 
 
 
220 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  50.45 
 
 
229 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  49.77 
 
 
245 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  48.52 
 
 
239 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  49.12 
 
 
246 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  51.75 
 
 
228 aa  205  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  48.7 
 
 
238 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  51.13 
 
 
245 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  50.89 
 
 
228 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  50.68 
 
 
245 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  51.33 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  49.04 
 
 
232 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0746  MIP family channel protein  50.44 
 
 
228 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  48.37 
 
 
260 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  48.91 
 
 
231 aa  197  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  49.12 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  48.91 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  48.47 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  47.32 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  47.77 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  47.32 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  49.56 
 
 
246 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  47.32 
 
 
221 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  47.32 
 
 
221 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  46.88 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  46.88 
 
 
221 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  48.47 
 
 
231 aa  195  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>