More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1100 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  100 
 
 
278 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  44.83 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  42.8 
 
 
239 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  41.15 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  39.41 
 
 
239 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  40.43 
 
 
245 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  41.67 
 
 
239 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  39 
 
 
250 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  37.6 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  42.68 
 
 
247 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  40.68 
 
 
239 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  41.81 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  39.22 
 
 
232 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  38.91 
 
 
246 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  37.5 
 
 
234 aa  122  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  36.82 
 
 
254 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  37.02 
 
 
231 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  42.22 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  37.24 
 
 
234 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  37.08 
 
 
246 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  36.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  36.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  34.26 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  37.76 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  39.66 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  36.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  36.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  36.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  36.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  33.86 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  33.86 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  33.86 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  33.86 
 
 
248 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  33.62 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  33.62 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  35.57 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  35.57 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  38.78 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  40.45 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  36.32 
 
 
230 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  36.75 
 
 
232 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  36.29 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  32.91 
 
 
231 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  37.7 
 
 
245 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.29 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  36.32 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  37.66 
 
 
237 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  35.62 
 
 
232 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  35.27 
 
 
245 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  37.82 
 
 
240 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  35.54 
 
 
235 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  34.87 
 
 
231 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  37.39 
 
 
221 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  35.71 
 
 
245 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  36.28 
 
 
227 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  35.12 
 
 
229 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  35.93 
 
 
221 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  35.93 
 
 
221 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  35.92 
 
 
251 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  37.66 
 
 
232 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  36.47 
 
 
243 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  34.88 
 
 
244 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  37.27 
 
 
243 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  36.4 
 
 
234 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  35.93 
 
 
226 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  37.27 
 
 
243 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  35.5 
 
 
221 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  35.59 
 
 
238 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  35.5 
 
 
221 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  35.93 
 
 
221 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  35.5 
 
 
221 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  34.32 
 
 
231 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  35 
 
 
231 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  35.42 
 
 
244 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  35.06 
 
 
221 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  34.58 
 
 
231 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  36.21 
 
 
230 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  35.78 
 
 
230 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  42.94 
 
 
252 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  35.93 
 
 
221 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  35.93 
 
 
221 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  37.89 
 
 
220 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  36.63 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  35.5 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  34.89 
 
 
231 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  35.44 
 
 
229 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  36.89 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  34.44 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  35.37 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  37.55 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  37.89 
 
 
232 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  34.57 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  35.74 
 
 
232 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  36.59 
 
 
234 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  36.67 
 
 
243 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  35.27 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  36.78 
 
 
295 aa  95.5  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  35 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  36.44 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  33.48 
 
 
218 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>