More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2467 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  80.93 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  83.61 
 
 		 238 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  75.73 
 
 		 247 aa  354  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  75.42 
 
 		 244 aa  347  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  72.73 
 
 		 234 aa  345  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  70.48 
 
 		 232 aa  331  8e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  70.18 
 
 		 237 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  71.11 
 
 		 232 aa  328  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  70.04 
 
 		 229 aa  327  8e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  71.43 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  73.64 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  72.2 
 
 		 230 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  70.22 
 
 		 232 aa  322  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  70.59 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  67.54 
 
 		 229 aa  321  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  71 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  69.96 
 
 		 230 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  71 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  70.56 
 
 		 230 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  69.82 
 
 		 229 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  67.86 
 
 		 229 aa  316  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  66.09 
 
 		 235 aa  315  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  71.3 
 
 		 232 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  67.24 
 
 		 231 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  67.41 
 
 		 231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  67.11 
 
 		 231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  66.67 
 
 		 232 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  66.96 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  66.07 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  66.07 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  65.62 
 
 		 231 aa  308  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  66.25 
 
 		 241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  65.91 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  66.96 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  66.52 
 
 		 229 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  65.45 
 
 		 245 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  65 
 
 		 245 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  66.36 
 
 		 234 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  67.42 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  67.42 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  67.42 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  67.42 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  67.42 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  67.42 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  67.42 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  66.97 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  70.42 
 
 		 246 aa  298  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  66.96 
 
 		 231 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  65.55 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  65.79 
 
 		 231 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  65.09 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  65.09 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  65.09 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  64.22 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  63.79 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  66.38 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  67.3 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  62.14 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  66.52 
 
 		 228 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  66.67 
 
 		 228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  68.12 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  68.12 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  62.13 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  63.96 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  65.35 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  64.78 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  65.35 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  65.35 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  64.78 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  65.35 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  64.78 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  64.26 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  65.35 
 
 		 231 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  64.91 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  62.88 
 
 		 234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  62.16 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  62.61 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  62.5 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  56.42 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2590  aquaporin Z  65.78 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  63.51 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  65.2 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  57.69 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  58.12 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  61.4 
 
 		 252 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0028  aquaporin Z  65.79 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322686  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  63.23 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  56.65 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  58.12 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  54.69 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  55.41 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  57.2 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0746  MIP family channel protein  58.15 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  56.59 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  53.3 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  55.11 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  53.49 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  53.49 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  53.49 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>