More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2042 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  100 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  60.41 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  56.73 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  55.14 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  52.72 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  52.72 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  56.1 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  52.28 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  51.45 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  44.83 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  38.37 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  38.37 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  39.04 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  38.28 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  37.89 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  37.75 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  38.31 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  38.1 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  37.65 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  35.97 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  35.57 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  35.57 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  35.57 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  36.9 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  36.9 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  36.9 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  36.69 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  35.92 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  36.9 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  36.9 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  36.9 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  34.52 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  35.97 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  36 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  35.57 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  35.56 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  34.52 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  36.48 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  34.82 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  37.9 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  40.57 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  40.57 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  36.65 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  36.22 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  34.41 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  34.51 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  34.4 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  35.1 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  34.01 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  34.01 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  33.86 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  36.11 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  36.33 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  35.18 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  33.46 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  33.85 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  35.29 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  34 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  36.65 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  35.18 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  32.53 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  35.86 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  31.73 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  35.34 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  35.74 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  36.4 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  34.26 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  35.34 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  33.47 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  33.47 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  35.68 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  35.37 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  35.06 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  41.71 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  33.72 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  35.2 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  31.4 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  32.24 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  30.99 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  34.24 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  33.47 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  30.99 
 
 		 221 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  34.94 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  36.14 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  34.71 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  30.99 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  34.25 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  30.99 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  30.99 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  32.8 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  30.99 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  32.67 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  36.07 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  34.55 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  32.89 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  31.75 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  32.93 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>