More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4099 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  100 
 
 
232 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  79.48 
 
 
229 aa  374  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  78.45 
 
 
232 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  77.63 
 
 
229 aa  364  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  79.39 
 
 
229 aa  362  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  77.29 
 
 
229 aa  361  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  75.86 
 
 
232 aa  361  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  76.21 
 
 
237 aa  355  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  75.88 
 
 
230 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  78.28 
 
 
231 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  75 
 
 
230 aa  349  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  75.33 
 
 
231 aa  347  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  75.88 
 
 
232 aa  346  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  73.48 
 
 
235 aa  345  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  76.47 
 
 
231 aa  344  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  75.57 
 
 
229 aa  343  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  74.24 
 
 
229 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  74.24 
 
 
229 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  74.89 
 
 
231 aa  340  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  74.89 
 
 
231 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  74.01 
 
 
231 aa  337  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  77.93 
 
 
232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  77.93 
 
 
232 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  77.93 
 
 
230 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  70.48 
 
 
240 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  72.32 
 
 
245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  76.02 
 
 
232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  71.3 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  70.43 
 
 
247 aa  325  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  324  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  71.74 
 
 
234 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  71.05 
 
 
231 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  69 
 
 
237 aa  322  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  71.3 
 
 
254 aa  321  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  71.43 
 
 
245 aa  320  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  76.56 
 
 
246 aa  320  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  69.13 
 
 
231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  70.76 
 
 
246 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  69.92 
 
 
246 aa  317  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  69.64 
 
 
234 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  66.52 
 
 
245 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  70 
 
 
247 aa  314  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  67.69 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  70 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  70 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  70.31 
 
 
241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  69.57 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  68.7 
 
 
248 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  72.99 
 
 
236 aa  310  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  69.79 
 
 
249 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  67.97 
 
 
244 aa  307  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  71.62 
 
 
246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  71.62 
 
 
246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  70.43 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  68.56 
 
 
238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  70 
 
 
231 aa  300  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  67.97 
 
 
243 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  70 
 
 
231 aa  299  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  69.37 
 
 
230 aa  298  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  67.98 
 
 
228 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  68.83 
 
 
234 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  67.1 
 
 
244 aa  289  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  66.95 
 
 
238 aa  288  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  66.23 
 
 
252 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  66.23 
 
 
228 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  68.72 
 
 
228 aa  284  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  65.11 
 
 
239 aa  281  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  65.77 
 
 
228 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  61.7 
 
 
238 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  64.04 
 
 
228 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  66.22 
 
 
228 aa  278  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  59 
 
 
251 aa  274  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  61.48 
 
 
260 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  60.87 
 
 
234 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2590  aquaporin Z  63.6 
 
 
228 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  61.8 
 
 
256 aa  266  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  58.78 
 
 
263 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  61.06 
 
 
246 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  61.26 
 
 
246 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0028  aquaporin Z  65.5 
 
 
231 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322686  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  64 
 
 
233 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  62.5 
 
 
246 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0746  MIP family channel protein  59.29 
 
 
228 aa  248  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  53.48 
 
 
229 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  56.74 
 
 
275 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  56.74 
 
 
275 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  56.74 
 
 
275 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  55.45 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  52.17 
 
 
243 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>