More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3163 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  100 
 
 
227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  70.75 
 
 
216 aa  299  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  40.19 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  40.19 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  38.2 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  35.22 
 
 
232 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  36.48 
 
 
234 aa  121  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  39.83 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  33.74 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  37.55 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  36.91 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  38.33 
 
 
231 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  38.3 
 
 
241 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  38.63 
 
 
240 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  37.95 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  34.75 
 
 
239 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  38.12 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  37.65 
 
 
263 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  36.73 
 
 
231 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  37.44 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  38.39 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  36.48 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  36.48 
 
 
247 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  34.76 
 
 
235 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  36.28 
 
 
231 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  36.44 
 
 
232 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  36.05 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  35.39 
 
 
245 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.84 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  34.6 
 
 
227 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  38.2 
 
 
244 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  39.74 
 
 
244 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  34.44 
 
 
247 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  35.53 
 
 
229 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  36.04 
 
 
278 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  35.04 
 
 
256 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  36.91 
 
 
234 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  34.93 
 
 
234 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  34.03 
 
 
234 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  40 
 
 
273 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  36.61 
 
 
237 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  37.34 
 
 
238 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  35.53 
 
 
246 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  34.43 
 
 
248 aa  105  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  38.66 
 
 
250 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  34.96 
 
 
232 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  34.98 
 
 
226 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  34.91 
 
 
231 aa  104  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  35.22 
 
 
232 aa  104  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  36.56 
 
 
228 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  34.58 
 
 
238 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  34.96 
 
 
232 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  36.89 
 
 
238 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02450  water channel, putative  35.1 
 
 
371 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.889441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  36.04 
 
 
232 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  35.37 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  39.73 
 
 
229 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  34.48 
 
 
231 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  39.29 
 
 
228 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  36.96 
 
 
243 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  34.96 
 
 
230 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  33.78 
 
 
229 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  37.55 
 
 
234 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  35.59 
 
 
239 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  33.74 
 
 
248 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  36.24 
 
 
234 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  34.8 
 
 
246 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  37 
 
 
228 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  34.33 
 
 
246 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  38.96 
 
 
231 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  38.96 
 
 
231 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  38.96 
 
 
231 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  39.3 
 
 
231 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  38.96 
 
 
231 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  34.78 
 
 
231 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  33.99 
 
 
260 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  34.33 
 
 
232 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  34.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  34.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  34.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  34.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  34.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  34.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  34.89 
 
 
232 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  39.3 
 
 
231 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  34.62 
 
 
247 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  39.3 
 
 
231 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  39.3 
 
 
231 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  30.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  34.89 
 
 
247 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  34.89 
 
 
247 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  34.89 
 
 
247 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  36.44 
 
 
251 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  36.97 
 
 
247 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  33.96 
 
 
239 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  34.06 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  38.53 
 
 
231 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  34.87 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  35.85 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  35.85 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>