More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0333 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  100 
 
 		 218 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  100 
 
 		 218 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  39.91 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  39.91 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  37.02 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  38.46 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  38.03 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  39.64 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  37.39 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  38.89 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  38.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  35.65 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  37.29 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  37.05 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  34.68 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  35.09 
 
 		 331 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  33.88 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  32.77 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  34.68 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  34.23 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  35.78 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  35.74 
 
 		 263 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  34.65 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  34.21 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  34.21 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  32.47 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  34.21 
 
 		 247 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  31.36 
 
 		 246 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  36.4 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  36.36 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  36.76 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  36.96 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  37.99 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  32.76 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  33.48 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  36.32 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  35.91 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  35.45 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  33.19 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  33.76 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  33.77 
 
 		 248 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02450  water channel, putative  33.77 
 
 		 371 aa  92.4  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.889441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  33.05 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  33.05 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  33.78 
 
 		 278 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  34.04 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  35.87 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  36.36 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  30.87 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  32.59 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  35.71 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  35.78 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  33.48 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  32.51 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  35.14 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  33.04 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  35.81 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  35.84 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  33.48 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  34.16 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  35.71 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  33.04 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  33.48 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  35.78 
 
 		 275 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  34.65 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  35.91 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  35.78 
 
 		 275 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  33.48 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  36.11 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  32.59 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  32.59 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  32.59 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  32.59 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  34.5 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  37.14 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  33.04 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  32.59 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  32.59 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  34.06 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  34.32 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  35.19 
 
 		 256 aa  88.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  32.31 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  33.62 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  33.47 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  35.22 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  34.21 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  32.14 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  35.59 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  35.93 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  35.29 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  34.38 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  37.89 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  34.67 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>