282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0489 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  100 
 
 
227 aa  443  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  41.46 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  41.46 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  34.98 
 
 
227 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  33.48 
 
 
216 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  33.04 
 
 
238 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  30.97 
 
 
234 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  35.85 
 
 
238 aa  99  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  34.26 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  33.9 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  33.19 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  32.29 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  33.77 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  32.88 
 
 
234 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  31.42 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  32.75 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  33.77 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  35 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  31.8 
 
 
249 aa  92.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  31.62 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  34.42 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  31.44 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  35.16 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  30.36 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  31.56 
 
 
235 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  31.86 
 
 
229 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  32.14 
 
 
234 aa  89  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  30.84 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  31.7 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  32.74 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  30.8 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  31.72 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  32.89 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  31.42 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  32.74 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  31.25 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  33.48 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  30.36 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  30 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  32.74 
 
 
247 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  35.94 
 
 
237 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  32.74 
 
 
247 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  29.28 
 
 
231 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  31.11 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  34.5 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  31.86 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  32.3 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  29.28 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  29.28 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  33.67 
 
 
273 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  30.18 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  31.68 
 
 
258 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  30.36 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  29.91 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  29 
 
 
246 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  31.56 
 
 
238 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  31.53 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  29.78 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  31.25 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  29.13 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  34.63 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  33.06 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  36.26 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  32.89 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  28.57 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  29.46 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  29.02 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  31.28 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  38.15 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  30.73 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  30.53 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  33.02 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  33.02 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  33.02 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  33.64 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  31.19 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  34.15 
 
 
243 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  33.79 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  29.2 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  32.7 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  32.7 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  30.53 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  34.12 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  30.7 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  34.42 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  30.97 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  33.95 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>