More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1895 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  100 
 
 
238 aa  473  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  51.89 
 
 
240 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  51.89 
 
 
240 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  40.93 
 
 
234 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  38.01 
 
 
226 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  38.89 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  37.66 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  37.7 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  35.32 
 
 
239 aa  122  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  35.65 
 
 
232 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  36.17 
 
 
229 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  35.62 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  36.59 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  37.16 
 
 
245 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  37.29 
 
 
246 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  38.33 
 
 
234 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  36.82 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  36.59 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  36.59 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  37.33 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  36.59 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  36.05 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  42.16 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  34.89 
 
 
239 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  36.52 
 
 
229 aa  118  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  35.43 
 
 
260 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  36.18 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  33.76 
 
 
234 aa  118  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  37.67 
 
 
246 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  34.89 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  38.32 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  37.89 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  38.32 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  37.1 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  40.28 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  38.26 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  34.47 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  38.49 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  36.59 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  37.1 
 
 
245 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  37.39 
 
 
249 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  36.44 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  38.43 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  35.68 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  38.46 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  35.68 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  39.21 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  37.91 
 
 
246 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  35.24 
 
 
232 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  35.85 
 
 
227 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  33.62 
 
 
237 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  37.91 
 
 
246 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  37.44 
 
 
227 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  34.63 
 
 
235 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  35.06 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  36.2 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  37.07 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  35.86 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  35.91 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  38.97 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  39.52 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  38.89 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  36.74 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  35.78 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  36.55 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  33.77 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  34.21 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  37.07 
 
 
221 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  37.07 
 
 
221 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  38.18 
 
 
234 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  36.59 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  36.21 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  36.59 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  36.59 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  36.19 
 
 
239 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  35.48 
 
 
250 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  35.43 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  37.71 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  36.36 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  36.36 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  34.19 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  35.29 
 
 
230 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  37.44 
 
 
228 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  34.19 
 
 
231 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  33.77 
 
 
232 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  34.89 
 
 
251 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  35.29 
 
 
230 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  35.47 
 
 
228 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  36.28 
 
 
248 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  33.47 
 
 
231 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  33.88 
 
 
245 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  35.39 
 
 
247 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  33.76 
 
 
231 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>