More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0790 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  35.29 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  35.29 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  36.59 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  40.8 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  35.12 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  35.24 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  38.05 
 
 		 216 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  32.6 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  33.64 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  38.67 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  34.48 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  33.18 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  35.32 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  33.62 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  34.39 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  34.51 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  33.77 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  34.1 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  37.43 
 
 		 250 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  33.18 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  38.92 
 
 		 239 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  34.55 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  33.61 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  32.79 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  34.07 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  32.72 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  33.77 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  35.65 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  34.7 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  32.26 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  34.7 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  34.05 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  34.7 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  33.77 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  34.86 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  34.8 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  33.33 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  33.33 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  33.33 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  33.33 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  32.88 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  33.33 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  33.33 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  33.8 
 
 		 232 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  33.61 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  34.25 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  33.49 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  31.44 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  33.03 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  32.57 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  31.19 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  34.58 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  33.8 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  33.02 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  30.7 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  33.03 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  33.79 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  31.16 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  30 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  31.53 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  33.64 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  29.68 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  34.26 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  32.76 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  30.09 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  32.72 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  34.72 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  33.49 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  32.72 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  31.05 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  31.91 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  36.24 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  32.41 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  35.02 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  31.65 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  33.63 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  31.34 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  34.36 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  30.88 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  32.7 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  34.36 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  32.87 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  31.94 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  35.32 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  29.03 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  30.26 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  34.25 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  30.09 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  32.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  32.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  32.82 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  30.84 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  32.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  32.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  32.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  32.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  31.02 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  31.62 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  32.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>