More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2523 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  100 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  58.43 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  55.82 
 
 		 268 aa  255  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  55.56 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  55.06 
 
 		 252 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  55.06 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  54.22 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  42.2 
 
 		 315 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  44.17 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  47.2 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  45.15 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  44.08 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  44.05 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  44.53 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  40.91 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  43.95 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  43.82 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  41.73 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  41.03 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  44.92 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  41.29 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  41.29 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  41.38 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  41.29 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  38.75 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  44.21 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  42.44 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  40.53 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  40.53 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  40.53 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  40.53 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  40.53 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  42.05 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  41.73 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  40.23 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  43.8 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  41.29 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  43.8 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  41.39 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  40.15 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  39.85 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  39.39 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  39.77 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  37.76 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  39.34 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  38.21 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  42.28 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  38.43 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  41.94 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  38.06 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  41.94 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  41.94 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  39.58 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  39.58 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  36.36 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  42.04 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  38.75 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  36.47 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  41.53 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  40.24 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  43.08 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  35.23 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  34.83 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  34.83 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  34.83 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  34.83 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  34.83 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  37.21 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  36.5 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  37.98 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  41.5 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  35.93 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  36.92 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  35.58 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  36.92 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  38.06 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  37.97 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  40.41 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  44.74 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  36.4 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  40.78 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  37.74 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  37.55 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  33.8 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>