More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4329 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  100 
 
 		 252 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  36.99 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  36.99 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  40.98 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  40.66 
 
 		 241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  40.35 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  40.76 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  39.91 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  41.05 
 
 		 232 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  41.89 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  42.66 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  42.04 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  41.05 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  41.05 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  42.34 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  37.28 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  36.33 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  39.84 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  40.37 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  39.84 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  39.84 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  39.84 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  40.37 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  40.64 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  40.64 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  39.29 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  40.44 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  42.41 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  37.76 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  37.35 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.81 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  35.5 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  34.96 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  38.84 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  35.37 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  37.07 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  38.03 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  36.21 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  38.46 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  38.46 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  38.86 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  39.46 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  40.44 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  34.51 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  35.34 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  39.22 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  35.8 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  40.95 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  40.95 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  37.99 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  34.93 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  36.6 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  34.93 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  36.44 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  39.19 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  40.27 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  34.98 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  38.63 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  39.29 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  38.46 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  34.51 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  34.82 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  36.65 
 
 		 230 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  39.15 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  34.07 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  34.51 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  35.48 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  39.41 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  34.07 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  36.28 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  37.39 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  34.07 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  34.07 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  34.07 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  34.07 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  37.56 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  35.42 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  35.27 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  35.22 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  31.91 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  40.42 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  37.39 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  35.56 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  33.62 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  36.12 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  36.24 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  38.57 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  37.96 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  38.5 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  34.07 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  33.62 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>