More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1307 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  94.76 
 
 		 231 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  95.2 
 
 		 231 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  93.89 
 
 		 231 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  91.7 
 
 		 231 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  92.58 
 
 		 231 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  91.7 
 
 		 231 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  85.84 
 
 		 235 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  82.1 
 
 		 232 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  77.09 
 
 		 229 aa  362  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  78.41 
 
 		 229 aa  358  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  76.86 
 
 		 230 aa  352  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  78.03 
 
 		 230 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  76.47 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  77.48 
 
 		 234 aa  347  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  76.92 
 
 		 237 aa  345  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  75.57 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  74.01 
 
 		 229 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  73.87 
 
 		 232 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  72.97 
 
 		 232 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  73.42 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  72.97 
 
 		 245 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  74.21 
 
 		 229 aa  333  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  73.76 
 
 		 229 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  72.07 
 
 		 245 aa  327  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  72.2 
 
 		 232 aa  324  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  74.11 
 
 		 247 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  72.2 
 
 		 232 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  72.2 
 
 		 230 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  74.11 
 
 		 248 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  73.21 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  73.21 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  73.21 
 
 		 247 aa  321  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  72.65 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  72.65 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  72.25 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  70.8 
 
 		 230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  70.42 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  72.32 
 
 		 231 aa  318  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  72.27 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  70.4 
 
 		 231 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  67.86 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  67.86 
 
 		 231 aa  314  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  72.99 
 
 		 246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  70.22 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  74.76 
 
 		 246 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  74.76 
 
 		 246 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  67.42 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  66.96 
 
 		 234 aa  305  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  69.82 
 
 		 236 aa  305  6e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  68.58 
 
 		 241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  66.22 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  68.78 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  70.09 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  67.26 
 
 		 228 aa  294  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  69.64 
 
 		 231 aa  294  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  67.26 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  69.64 
 
 		 231 aa  292  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  70.85 
 
 		 228 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  68.33 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  68.47 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  65.02 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  64.63 
 
 		 228 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  65.04 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  66.67 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  62.87 
 
 		 239 aa  286  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  64.68 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  65.47 
 
 		 228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  59.31 
 
 		 251 aa  276  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  64.16 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  64 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  64.35 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2590  aquaporin Z  63.76 
 
 		 228 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  63.39 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  64.14 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  66.37 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  59.46 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  59.46 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  56.9 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0028  aquaporin Z  64.47 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322686  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  59.71 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0746  MIP family channel protein  60.18 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  57.83 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  57.83 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  57.83 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  60.51 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  53.81 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  50.89 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>