More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0028 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0028  aquaporin Z  100 
 
 
231 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322686  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  83.11 
 
 
228 aa  354  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  82.67 
 
 
228 aa  354  6.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  83.56 
 
 
228 aa  346  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  72.29 
 
 
231 aa  314  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  74.77 
 
 
228 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  71.43 
 
 
231 aa  308  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  68.67 
 
 
254 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  75.45 
 
 
228 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  68.67 
 
 
234 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  68.38 
 
 
247 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  72.29 
 
 
231 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  72.29 
 
 
231 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  72.29 
 
 
231 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  68.38 
 
 
247 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  68.38 
 
 
247 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  72.29 
 
 
231 aa  292  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  68.38 
 
 
247 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  72.29 
 
 
231 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  68.38 
 
 
248 aa  292  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  68.86 
 
 
229 aa  291  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  67.39 
 
 
229 aa  291  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  71.86 
 
 
231 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  71.86 
 
 
231 aa  291  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  71.86 
 
 
231 aa  291  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  71.86 
 
 
231 aa  290  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  66.67 
 
 
230 aa  289  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  69.57 
 
 
246 aa  288  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  68.26 
 
 
237 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  66.67 
 
 
230 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  72.38 
 
 
236 aa  287  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  65.79 
 
 
240 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  67.11 
 
 
229 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  67.11 
 
 
229 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  67.26 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  66.1 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  72.07 
 
 
228 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  66.52 
 
 
234 aa  281  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2590  aquaporin Z  73.66 
 
 
228 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  64.78 
 
 
232 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  65.5 
 
 
232 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  63.04 
 
 
232 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  64.91 
 
 
231 aa  280  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  67.11 
 
 
229 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  64.47 
 
 
229 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  67.11 
 
 
238 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  71.29 
 
 
246 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  71.29 
 
 
246 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  65.35 
 
 
234 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  66.52 
 
 
246 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  64.47 
 
 
231 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  64.47 
 
 
231 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  67.87 
 
 
229 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  64.04 
 
 
231 aa  277  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  64.89 
 
 
231 aa  277  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  63.6 
 
 
231 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  63.95 
 
 
238 aa  275  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  66.52 
 
 
232 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  65.67 
 
 
239 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  66.52 
 
 
230 aa  274  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  64.46 
 
 
256 aa  274  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  67.26 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  66.08 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0746  MIP family channel protein  67.12 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  61.67 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  62.72 
 
 
230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  64.68 
 
 
249 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  64.32 
 
 
246 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  64.04 
 
 
237 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  63.88 
 
 
246 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  61.3 
 
 
232 aa  269  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  63.51 
 
 
245 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  64.47 
 
 
247 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  63.51 
 
 
245 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  64.86 
 
 
234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  64.78 
 
 
244 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  63.96 
 
 
245 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  68.3 
 
 
233 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  63.68 
 
 
231 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  65.35 
 
 
238 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  62.71 
 
 
252 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  63.44 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  63.39 
 
 
241 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  64.36 
 
 
232 aa  249  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  61.14 
 
 
243 aa  247  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  59.57 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  56.09 
 
 
234 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  57.2 
 
 
275 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  57.2 
 
 
275 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  57.2 
 
 
275 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  59.58 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  61.4 
 
 
244 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  48.46 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  50 
 
 
248 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>