More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0047 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  100 
 
 
250 aa  488  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  38.49 
 
 
221 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  38.49 
 
 
221 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  38.49 
 
 
221 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  39.33 
 
 
221 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  39 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  37.77 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  37.96 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  36.97 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  39.73 
 
 
243 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  41.07 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  36.59 
 
 
234 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  39 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  39.01 
 
 
243 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  35.23 
 
 
263 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  38.29 
 
 
236 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  35.18 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  38.71 
 
 
398 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  39.91 
 
 
238 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  37.39 
 
 
230 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  39.91 
 
 
234 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  35.34 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  35.22 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  36.32 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  34.69 
 
 
231 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  33.98 
 
 
234 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  37.45 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  37.45 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  38.17 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  36.67 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  33.2 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  33.86 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  35.54 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  32.81 
 
 
247 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  37.28 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  34.84 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  36.03 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  35.25 
 
 
230 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  31.89 
 
 
247 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  35.95 
 
 
229 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  35.37 
 
 
232 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  36.4 
 
 
226 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  35.04 
 
 
241 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  36.33 
 
 
228 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  36.8 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  36.36 
 
 
229 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  34.84 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  32.28 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  32.28 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  35.27 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  32.28 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  33.62 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  37.97 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  36.32 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  35.5 
 
 
234 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  36.59 
 
 
228 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.18 
 
 
239 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  33.62 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  34.69 
 
 
231 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  34.69 
 
 
231 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  37.23 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  34.17 
 
 
234 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  35.9 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  34.29 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  38.99 
 
 
231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  33.74 
 
 
234 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  33.74 
 
 
234 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  33.74 
 
 
234 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  33.74 
 
 
234 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  33.74 
 
 
234 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  33.74 
 
 
234 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  33.58 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  33.61 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4068  Aquaporin Z  31.67 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  38.99 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  33.74 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  36.13 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  33.88 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  36.13 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  32.52 
 
 
254 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  34.44 
 
 
232 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  32.93 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  35.56 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  33.33 
 
 
234 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  38.53 
 
 
231 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  32.13 
 
 
237 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  36.28 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  33.03 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>