More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1040 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  100 
 
 
243 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  88.89 
 
 
243 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  88.89 
 
 
243 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  55.86 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  58.02 
 
 
220 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  53.3 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  50 
 
 
232 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  51.77 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  49.57 
 
 
246 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  54.5 
 
 
226 aa  194  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  50 
 
 
249 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  49.57 
 
 
246 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  49.12 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  49.12 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  49.12 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  49.12 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  49.12 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  49.12 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  48.67 
 
 
247 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  48.67 
 
 
247 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  48.67 
 
 
247 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  48.67 
 
 
254 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  51.56 
 
 
247 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  48.67 
 
 
248 aa  190  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  48.67 
 
 
234 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  48.23 
 
 
247 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  50.91 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  47.84 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  52.58 
 
 
243 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  51.18 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  51.18 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  50.45 
 
 
232 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  50.45 
 
 
230 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  49.56 
 
 
245 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  47.98 
 
 
231 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  47.79 
 
 
235 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  46.81 
 
 
241 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  48.25 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  49.56 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  48.67 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  49.32 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  46.61 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  46.35 
 
 
231 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  49.77 
 
 
232 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  46.9 
 
 
229 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  48.43 
 
 
230 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  46.9 
 
 
231 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  52.23 
 
 
228 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  46.9 
 
 
231 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  50.89 
 
 
228 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  46.9 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  47.98 
 
 
230 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  49.33 
 
 
221 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  49.33 
 
 
221 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  45.87 
 
 
263 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  49.33 
 
 
221 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  49.33 
 
 
221 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  48.23 
 
 
231 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  50.93 
 
 
229 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  49.78 
 
 
221 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  45.69 
 
 
231 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  49.33 
 
 
221 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  50.22 
 
 
221 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  45.26 
 
 
231 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  49.77 
 
 
238 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  48.88 
 
 
221 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  46.85 
 
 
234 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  50 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  45.3 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  48.66 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  44.87 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  49.11 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  49.09 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  43.81 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  50.67 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  45.61 
 
 
231 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  48.15 
 
 
234 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  46.95 
 
 
236 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  45.05 
 
 
246 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  50.67 
 
 
221 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  50.67 
 
 
221 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  48.39 
 
 
246 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  46.58 
 
 
238 aa  168  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  44.35 
 
 
256 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  45.92 
 
 
239 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  48.58 
 
 
237 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  44.44 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  46.08 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  47.25 
 
 
228 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2590  aquaporin Z  51.34 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  47.42 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  45.93 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  43.78 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  47.71 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  47.87 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  44.54 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  47 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  47.39 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  47.39 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  47.39 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>