More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1929 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  100 
 
 		 247 aa  470  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  69.8 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  68.98 
 
 		 245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  71.31 
 
 		 247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  64.08 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  56.38 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  62.45 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  64.49 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  64.49 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  56.68 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  43.51 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  38.04 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  37.35 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  40.77 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  36.4 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  36 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  40.65 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  36 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  38.27 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  36 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  36 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  38.43 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  38.8 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  36 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  39.84 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  41.05 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  36.58 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  36.29 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  37.6 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  38.15 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  38.82 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  39.59 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  36.29 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  35.71 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  38.4 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  35.89 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  40.56 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  36.22 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  37.65 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  35.36 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  38.15 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  38.4 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  37.01 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  33.2 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  36.19 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  38.04 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  39.42 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  41.13 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  34.98 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  38.25 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  36.22 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  38.65 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  35.83 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  37.85 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  36.8 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  35.37 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  37.2 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  34.98 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  39.09 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  36.07 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  39.11 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  37.5 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  36.61 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  34.85 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  34.85 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  34.85 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  37.05 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  35.66 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  35.69 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  33.58 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  40.39 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  37.4 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  35.92 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  33.08 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  32.71 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  33.08 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  33.08 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  33.08 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  39.44 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  33.08 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  38.06 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  34.85 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  38.91 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  32.71 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  36.18 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  35.57 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  37.15 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  38.52 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  38.52 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  33.46 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>