More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0810 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  91.6 
 
 		 251 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  76.89 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  55.06 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  52.44 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  51.61 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  48.97 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  46.47 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  45.34 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  45.34 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  45.87 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  43.02 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  42.45 
 
 		 315 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  46.5 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  43.09 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  42.21 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  44.53 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  46.78 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  40.8 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  39.62 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  42.68 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  44.35 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  45.65 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  43.83 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  40.33 
 
 		 282 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  43.83 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  41.28 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  41.28 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  40 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  39.76 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  44.44 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  40.66 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  42.86 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  42.86 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  39.69 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  42.62 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  39.31 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  39.31 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  41.34 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  39.13 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  41.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  38.89 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  39.44 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  38.65 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  39.92 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  39.92 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  39.92 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  37.9 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  38.27 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  40 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  37.77 
 
 		 232 aa  135  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  41.6 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  42.02 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  40.17 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  37.87 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  42.42 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  38.06 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  38.06 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  38.06 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  38.06 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  38.06 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  36.72 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  42.24 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  42.02 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  42.37 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  42.37 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  42.02 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  37.25 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  41.6 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  37.71 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  41.6 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  37.7 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  41.6 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  39.92 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  41.6 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  38.46 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  39.83 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  35.32 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  41.95 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  41.6 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  37.85 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  41.92 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  39.17 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  35.34 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  41.95 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  35.59 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  35.74 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  38.4 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  34.92 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  34.92 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  36.9 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  37.45 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>