More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0109 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  100 
 
 
283 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  92.58 
 
 
281 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  85.41 
 
 
279 aa  494  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  85.05 
 
 
279 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  84.75 
 
 
282 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  84.75 
 
 
282 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  84.75 
 
 
282 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  84.04 
 
 
281 aa  477  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  81.16 
 
 
281 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  80.8 
 
 
281 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  79.5 
 
 
281 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  79.78 
 
 
281 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  80.14 
 
 
281 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  80.43 
 
 
281 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  80.14 
 
 
281 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  80.14 
 
 
281 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  80.14 
 
 
281 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  76.38 
 
 
279 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  74.9 
 
 
279 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  70.96 
 
 
283 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  72.18 
 
 
283 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  72.18 
 
 
283 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  72.37 
 
 
283 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  69.34 
 
 
283 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  72.55 
 
 
285 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  71.21 
 
 
269 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  69.85 
 
 
264 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  67.84 
 
 
279 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  69.85 
 
 
264 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  69.85 
 
 
264 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  69.85 
 
 
264 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  69.85 
 
 
264 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  71.32 
 
 
285 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  68.75 
 
 
265 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  62.32 
 
 
284 aa  344  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  61.75 
 
 
284 aa  338  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  64.57 
 
 
275 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  64.89 
 
 
284 aa  335  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  64.5 
 
 
284 aa  331  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  61.73 
 
 
289 aa  321  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  41.52 
 
 
279 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  41.09 
 
 
295 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  40.79 
 
 
279 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  39.13 
 
 
282 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  41.54 
 
 
268 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  41.76 
 
 
275 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  41.76 
 
 
275 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  39.27 
 
 
338 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  40.81 
 
 
284 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  39.25 
 
 
274 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  38.77 
 
 
315 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  36.36 
 
 
295 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  42.05 
 
 
274 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  40.68 
 
 
273 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  42.64 
 
 
275 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  41.09 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  40.08 
 
 
281 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  38.08 
 
 
281 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  39.61 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  40 
 
 
271 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  35.59 
 
 
340 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  39.52 
 
 
251 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  39.92 
 
 
251 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  39.13 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3166  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 
192 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0972296  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  37.41 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  36.73 
 
 
270 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  36.1 
 
 
449 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  40.16 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  39.04 
 
 
242 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  37.11 
 
 
250 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  37.3 
 
 
235 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  40.57 
 
 
272 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  40.57 
 
 
272 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  37.4 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  37.4 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07618  MIP aquaporin (Eurofung)  32.68 
 
 
612 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82255  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  35.54 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  36.84 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  38.06 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  34.96 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  38.91 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  37.9 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  38.46 
 
 
236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  39.39 
 
 
242 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  36.03 
 
 
240 aa  109  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>