More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0897 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  58.74 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  42.17 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  44.63 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  40.6 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  40.6 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  40.6 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  40.83 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  40.83 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  38.11 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  40.75 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  39.55 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  42.5 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  40.83 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  42.92 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  41.67 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  41.67 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  40.42 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  40.38 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  39.18 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  39.25 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  38.81 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  40 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  39.27 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  39.85 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  40.23 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  38.43 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  38.43 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  38.43 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  38.43 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  38.43 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  39.18 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  39.18 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  39.18 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  39.18 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  39.18 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  40.59 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  36.69 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  36.8 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  35.16 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  36.84 
 
 		 269 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  39.09 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  33.82 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  38.27 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  37.08 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  33.46 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  37.24 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  32.96 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  35.59 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  34.7 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  34.27 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  34.21 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  33.58 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  34.41 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  33.2 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  34.73 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  36.18 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  33.21 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  35.77 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  34.65 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  32.95 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  34.41 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  34.41 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  34.41 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  32.4 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  34.29 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  34.41 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  34.41 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  34.41 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  34.41 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  34.02 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  33.6 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  33.6 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  29.12 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  32.45 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  35.43 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  36.32 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  32.6 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  32.51 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  38.68 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  32.45 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  32.09 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  31.27 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  31.27 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  32.81 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  36.79 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  31.15 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  33.61 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  31.52 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  32.86 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  33.48 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  34.67 
 
 		 398 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  30.83 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  32.26 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>