More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1653 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 
237 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  62.45 
 
 
242 aa  301  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  62.39 
 
 
238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  60.17 
 
 
236 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  56.28 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  52.63 
 
 
232 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  55.84 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  54.74 
 
 
273 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  52.48 
 
 
247 aa  249  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  55.17 
 
 
272 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  55.17 
 
 
272 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
274 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  55.6 
 
 
273 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  56.03 
 
 
278 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  56.03 
 
 
273 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
273 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
273 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
273 aa  244  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  54.74 
 
 
273 aa  244  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
273 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  55.17 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  51.5 
 
 
241 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  55.13 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  48.97 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  54.42 
 
 
242 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  48.92 
 
 
235 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  50.84 
 
 
242 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  48.26 
 
 
235 aa  222  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  47.83 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  47.83 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  50 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  55 
 
 
244 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  47.19 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  50.44 
 
 
247 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  48.48 
 
 
238 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  46.75 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  47.62 
 
 
238 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  48.78 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  49.34 
 
 
233 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  49.55 
 
 
242 aa  209  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  50.22 
 
 
244 aa  208  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  47.9 
 
 
243 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  47.73 
 
 
238 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  49.37 
 
 
246 aa  205  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  48.17 
 
 
238 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  47.66 
 
 
240 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  48.17 
 
 
238 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  48.17 
 
 
238 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  48.17 
 
 
238 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  48.17 
 
 
238 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  48.17 
 
 
238 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  47.41 
 
 
241 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  48.09 
 
 
239 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  51.35 
 
 
249 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  45.22 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  49.56 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  46.12 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  48.29 
 
 
249 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  47.7 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  42.29 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  46.09 
 
 
240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  48.26 
 
 
249 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  42.98 
 
 
243 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  45.41 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  45 
 
 
244 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  46.9 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  42.49 
 
 
250 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  42.06 
 
 
244 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  44.44 
 
 
245 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  41.49 
 
 
268 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  38.02 
 
 
289 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  38.27 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  42.44 
 
 
246 aa  162  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  42.44 
 
 
259 aa  159  3e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  42.52 
 
 
244 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  41.49 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  41.74 
 
 
279 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  39.85 
 
 
315 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  36.36 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  39.52 
 
 
284 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  41.2 
 
 
267 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  39.92 
 
 
251 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  38.82 
 
 
251 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  39.11 
 
 
254 aa  138  7e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  35.42 
 
 
287 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  37.65 
 
 
295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  31.79 
 
 
287 aa  134  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  40.17 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  40.86 
 
 
338 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  31.38 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  38.27 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  31.37 
 
 
282 aa  128  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  37.86 
 
 
281 aa  128  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>