More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44871 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  41.96 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  42.17 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  40.39 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  40.39 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  40 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  39.44 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  39.61 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  42.41 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  40.68 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  42.02 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  40.3 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  40.68 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  40.36 
 
 		 281 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  41.06 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  40.68 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  41.06 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  39.93 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  41.06 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  41.63 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  39.44 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  38.1 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  39.44 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  41.25 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  41.25 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  41.25 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  41.25 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  41.25 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  38.71 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  38.65 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  39.84 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  38.58 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  37.55 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  37.94 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  39.04 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  38.19 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  38.19 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  39.84 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  37.85 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  37.85 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  37.85 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  37.85 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  37.85 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  36.76 
 
 		 289 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  35.21 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  37.93 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  37.93 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  36.29 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  37.25 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  33.21 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  34.93 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  32.33 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  33.46 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  32.95 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  32.84 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  33.84 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  33.21 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  36 
 
 		 331 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  31.13 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  34.21 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  32.88 
 
 		 449 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  30.16 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  33.46 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  33.06 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  32.65 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  33.47 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  33.96 
 
 		 398 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  31.58 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  29.51 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  31.8 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  29.51 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  31.67 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  29.67 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  29.51 
 
 		 230 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2529  MIP family channel protein  32.97 
 
 		 339 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00000981232  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  31.1 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  31.76 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  31.12 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  31.42 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  33.61 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  32.39 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  29.71 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  29.96 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  30.92 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  30.31 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  29.84 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  32.13 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  32.64 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  32.64 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  30.31 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  30.43 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  30.42 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  32.64 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>