More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4531 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  84.31 
 
 		 283 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  84.31 
 
 		 283 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  83.21 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  80.78 
 
 		 283 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  78.17 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  77.46 
 
 		 285 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  83.21 
 
 		 279 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  82.06 
 
 		 279 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  73.82 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  69.06 
 
 		 281 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  67.99 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  70.15 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  72.76 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  70.94 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  67.27 
 
 		 281 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  70.15 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  72.37 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  67.51 
 
 		 281 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  70.15 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  70.15 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  70.15 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  70.94 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  70.94 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  67.63 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  68.82 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  72.37 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  67.32 
 
 		 269 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  67.7 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  67.7 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  67.7 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  67.7 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  67.7 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  62.26 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  63.36 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  62.65 
 
 		 284 aa  324  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  61.83 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  62.69 
 
 		 284 aa  322  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  59.14 
 
 		 275 aa  314  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  58.91 
 
 		 289 aa  308  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  40.21 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  40.52 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  39.38 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  37.76 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  41.96 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  40.56 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  39.44 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  41.92 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  41.92 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  41 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  40 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  39.44 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  40.76 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  38.11 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  40.67 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  36.69 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  35.79 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  35.51 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  36.84 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  38.19 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  36.4 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  39.2 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3166  glycerol uptake facilitator protein  46.01 
 
 		 192 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0972296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  35.18 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  35.1 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  39.84 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  36.65 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  33.8 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  37.9 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  38.91 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  35.74 
 
 		 252 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  40.57 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  40.57 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  37.3 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  32.35 
 
 		 449 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  37.65 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  35.02 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07618  MIP aquaporin (Eurofung)  34.17 
 
 		 612 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  38.94 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  34.8 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  37.8 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  37.8 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  36.48 
 
 		 232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  40.38 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  40.38 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  40.38 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 236 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  38.84 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  36.08 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  36.08 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  36.89 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  36.08 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>