97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3166 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3166  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0972296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  64.24 
 
 		 284 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  61.82 
 
 		 284 aa  191  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  62.42 
 
 		 284 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  60 
 
 		 284 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  53.94 
 
 		 289 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  49.09 
 
 		 283 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  49.09 
 
 		 283 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  49.09 
 
 		 283 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  49.69 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  49.69 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  49.69 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 		 281 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 		 281 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 		 281 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 		 281 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 		 281 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  49.69 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  47.27 
 
 		 283 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  49.08 
 
 		 279 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  47.24 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  47.24 
 
 		 281 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  46.63 
 
 		 279 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  47.85 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  49.69 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  46.63 
 
 		 281 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  48.47 
 
 		 281 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  46.01 
 
 		 283 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  46.63 
 
 		 281 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  45.4 
 
 		 285 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  45.4 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  44.79 
 
 		 279 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  44.24 
 
 		 285 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  42.33 
 
 		 264 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  42.33 
 
 		 264 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  42.33 
 
 		 264 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  42.33 
 
 		 264 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  42.33 
 
 		 264 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  42.94 
 
 		 265 aa  117  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  42.33 
 
 		 269 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  39.26 
 
 		 275 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  32.16 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  35.71 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  32.18 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  31.87 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  29.89 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  31.87 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  32.93 
 
 		 252 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  32.93 
 
 		 251 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  28.32 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  31.34 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  32.18 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  29.61 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  30.29 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  33.95 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  29.14 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  29.03 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  31.34 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  31.21 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  31.39 
 
 		 282 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07618  MIP aquaporin (Eurofung)  26.78 
 
 		 612 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  32 
 
 		 281 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  29.77 
 
 		 449 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  31.38 
 
 		 255 aa  51.2  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  26.46 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  32.98 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  30.65 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  31.36 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  29.84 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  33.93 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  29.17 
 
 		 250 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  25.75 
 
 		 267 aa  48.5  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  34.57 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  32.04 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  34.57 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  32.9 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  27.88 
 
 		 247 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  29.14 
 
 		 249 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  28.04 
 
 		 271 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  33.53 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  30.52 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  29.94 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  29.09 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  28.57 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  27.33 
 
 		 234 aa  41.2  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  33.13 
 
 		 278 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  33.13 
 
 		 278 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  29.94 
 
 		 255 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  33.13 
 
 		 273 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  33.13 
 
 		 273 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>