More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1915 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  58.74 
 
 		 274 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  42.74 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  43.15 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  40.24 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  40.66 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  41.91 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  40.66 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  41.08 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  41.08 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  40.76 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  37.36 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  39.25 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  37 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  40.25 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  39.84 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  39.84 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  39.84 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  39.84 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  36.63 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  39.84 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  38.01 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  38.01 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  38.01 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  39.83 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  38.71 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  36.46 
 
 		 338 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  32.5 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  35.87 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  37.36 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  35.87 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  35.87 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  35.87 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  35.87 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  40.08 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  36.15 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  36.15 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  36.53 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  36.76 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  34.91 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  35 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  33.7 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  32.73 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  36.48 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  32.58 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  31.71 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  31.36 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  32.96 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  33.58 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  31.18 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  35.11 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  35.66 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  33.71 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  29.73 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  36.61 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  31.95 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  33.46 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  32.51 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  31.8 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  35.42 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  29.72 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  31.76 
 
 		 231 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  31.08 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  29.89 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  30 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  31.87 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  29.84 
 
 		 273 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  30.12 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  28.04 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  29.03 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  29.77 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  31.87 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  29.53 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  31.73 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  31.23 
 
 		 241 aa  95.9  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  28.52 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  31.93 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  30.16 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  30.04 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  30.19 
 
 		 250 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  28.89 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  30.23 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  30.04 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  28.31 
 
 		 248 aa  93.2  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  28.74 
 
 		 240 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  28.21 
 
 		 239 aa  92.8  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  28.74 
 
 		 240 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  29.32 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  29.32 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  30.56 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  32.39 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>