More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4418 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  99.64 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  99.64 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  99.64 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  99.64 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  92.53 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  92.17 
 
 		 281 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  92.17 
 
 		 281 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  90.04 
 
 		 281 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  82.27 
 
 		 282 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  82.27 
 
 		 282 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  82.27 
 
 		 282 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  81 
 
 		 279 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  81.49 
 
 		 281 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  81.82 
 
 		 281 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  79.93 
 
 		 279 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  79.78 
 
 		 283 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  71 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  69.42 
 
 		 283 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  70.26 
 
 		 285 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  69.42 
 
 		 283 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  70.15 
 
 		 283 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  69.78 
 
 		 283 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  74.52 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  69.06 
 
 		 283 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  74.42 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  72.09 
 
 		 279 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  68.7 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  68.7 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  68.7 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  68.7 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  68.7 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  67.82 
 
 		 269 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  68.22 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  64.66 
 
 		 284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  63.93 
 
 		 284 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  66.41 
 
 		 284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  66.02 
 
 		 284 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  63.56 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  61.37 
 
 		 289 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  41.97 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  41.97 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  40.81 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  40.52 
 
 		 268 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  40.21 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  39.77 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  39.41 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  39.41 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  38.31 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  38.26 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  40.79 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  40.53 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  41.04 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  41.25 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  40.08 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  38.43 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  35.87 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  38.16 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  37.78 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  41.44 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  39.04 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  35.89 
 
 		 449 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  40.16 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3166  glycerol uptake facilitator protein  47.85 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0972296  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  39.36 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  39.27 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  38.74 
 
 		 242 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  40 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  38.06 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07618  MIP aquaporin (Eurofung)  36.29 
 
 		 612 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  38.04 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  35.1 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  39.44 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  38.21 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  38.21 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  39.04 
 
 		 235 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  39.02 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  37.45 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  36.65 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  34.01 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  35.16 
 
 		 240 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  36.76 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  35.22 
 
 		 242 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  37.2 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  35.37 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  35.64 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  34.98 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  35.71 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  35.71 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  35.71 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  35.71 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  35.71 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>