More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1001 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  67.67 
 
 		 235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  66.81 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  56.84 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  57.92 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  57.26 
 
 		 275 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  58.97 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  57.76 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  57.69 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 273 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 273 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  57.26 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  57.69 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  55.27 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  57.26 
 
 		 273 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  57.26 
 
 		 278 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  52.78 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  58.45 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  52.19 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  51.25 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  53.85 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  53.04 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  53.04 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  50.42 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  51.74 
 
 		 274 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  49.57 
 
 		 237 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  49.14 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  49.79 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  54.78 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  52.54 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  51.29 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  47.83 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  47.84 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  50.88 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  46.98 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  50 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  53.49 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  49.58 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  49.54 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  49.54 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  49.08 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  49.08 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  49.08 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  49.54 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  48.18 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  45.83 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  45.89 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  48.66 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  48.98 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  48.51 
 
 		 249 aa  207  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  49.36 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  47.01 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  47.48 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  46.98 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  47.83 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  48.88 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  45 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  45.68 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  45.61 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  44.21 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  46.49 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  46.78 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  45.02 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  47.37 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  44.26 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  42.01 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  40.96 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  47.28 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  48.44 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  37.23 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  42.98 
 
 		 259 aa  170  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  36.65 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  40.44 
 
 		 244 aa  158  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  41.32 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  40.6 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  39.58 
 
 		 274 aa  148  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  37.23 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  41.28 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  40.85 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  39.48 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  41.06 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  38.02 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  39.27 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  40.65 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  37.82 
 
 		 279 aa  134  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  37.39 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  39.84 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>