103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1538 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  100 
 
 		 231 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.91 
 
 		 453 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.85 
 
 		 408 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  35.81 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  39.09 
 
 		 271 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  38.97 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  36.09 
 
 		 247 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  34.55 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  38.07 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  35.21 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  34.07 
 
 		 260 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  36.67 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  34.42 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  36.62 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  37.09 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  36.87 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  36.81 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  33.63 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  34.93 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  33.18 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  32.57 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  34.91 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  31.33 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  34.43 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  32.57 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  32.09 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  27.11 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  31.6 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  31.84 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  32.99 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  33.14 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  34.43 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  33.14 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  28.3 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  27.83 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  28.92 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  28.7 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  27.83 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  27.83 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  27.36 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1589  major intrinsic protein  28.82 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  27.36 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  27.36 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  34.4 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  28.79 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2529  MIP family channel protein  33.05 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00000981232  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  36.36 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  27.36 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  29.13 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  27.83 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  27.83 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  29.91 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  28.64 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  29.07 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  28.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  31.44 
 
 		 398 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  30.45 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  28.82 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  25.66 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  28.63 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  26.24 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  26.24 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  30.14 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  39.56 
 
 		 357 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  28.87 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  28.87 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  28.87 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  33.33 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  30.43 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  27.52 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0746  MIP family channel protein  29.87 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  29.83 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  27.56 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  26.43 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  29.23 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28080  permease, glycerol uptake facilitator  38.37 
 
 		 448 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.543905  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  29.38 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  29.38 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  28.65 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  29.82 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  29.91 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  29.38 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  29.26 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  34.07 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  29.38 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  29.38 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  29.38 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  31.06 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  26.02 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  29.38 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  26.52 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  30.83 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  29.79 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  27.4 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  28.12 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  27.72 
 
 		 278 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  29 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  29.68 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  29.18 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>